L'histoire est centrée sur Link et sa quête pour sauver le royaume d'Hyrule du maléfique Ganondorf. Son aventure le mènera à sauver la princesse Zelda et conquérir la légendaire Triforce. Ce jeu est mythique, la durée de vie est impressionnante grâce à l'idée de génie d'utiliser la même carte des niveaux pour doubler la durée de vie. (Monde de la lumière et le monde des ténèbres).